一、水部
水之一 天水类
雨水
即天上降落的雨，在唐时已有梅雨之名[18]。唐开元时陈藏器说：“江淮以南，地气卑湿。五月上旬连雨，下旬尤甚。月令，土润溽暑，是五月中气，过此节以后，皆须曝书。梅雨沾衣，便腐黑，浣垢如灰汁，有异他水。”这是梅水时期发霉的结果。
水之二 地水类
流水
本草说：“流水者，大而江河，小而溪涧，皆流水也。其外动而性静，其质柔而气刚，与湖泽陂塘之止水不同。然江河水浊，而溪涧之水清，复有不同焉。观浊水、流水之鱼，与清水、止水之鱼，性色迥别。淬剑染帛，色各不同。煮粥烹茶，味亦有异。”对于流水、止水性情不同，可以说是从各面来考虑的。现在我们区别水性往往只靠化学分析，考虑客观条件，还没有本草全面。
井泉水
明正德时汪颖说：“与诸水不同，凡井水有远从地脉来者为上，有从近处江湖渗来者次之，其城市近沟渠污水杂入者，成碱。用须煎滚，候冷澄清，乃用之。……雨后水浑，须捣桃、杏仁澄之。”从这里可以知道井水的来源有三种，有地下水从远处来的，有江湖渗入的，有附近脏水渗入的。泉水来源愈远愈好。而澄清水的方法是用桃、杏仁打碎的办法，很值得研究。而现在都是用明矾。
对于井水与居住的关系，本草说：“凡井以黑铅[19]为底，能清水散结，人饮之无疾。入丹砂镇之，令人多寿。”黑铅疑得方铅矿，丹砂即辰砂。是否如此，尚待证明。但注意到水对人生的影响，颇值得研究。现在已知纯粹蒸馏水对人并不合适，应该如何办呢？这里提出是水里放辰砂，可以“延年益寿”。
本草引麻知几水解云：“太史召司水者、曰，此水已三周环，水滑则漏迟，漏迟则刻差，当易薪水。”在没有钟钱以前，计时的铜漏，要求精确的程度，考虑到水只能应用三次。又说：“天下之水，用之灭火则同，濡搞则同。至于性从地变，质与物迁，未尝同也。故蜀江濯锦则鲜，济源烹楮则晶。南阳之潭渐于菊，其人多寿。辽东之涧通于侵，其人多发。晋之山产蓬石，泉可愈疽。戎之麓伏硫黄，汤可浴疠。……千派万种，言不可尽。……”对于水与人生的关系，水的性质，可以算是澈底了解。颇可供水文地质学家的参考。
节气水
本草认为节气水各有不同：“一年二十四节气，一节主半月，水之气味，随之变迁。此乃天地之气候相感，又非疆域之限也。”更妙的是“每日以瓦瓶秤水，视其轻重。重则雨多，轻则雨少”。用这种方法来判定晴雨，很有科学道理。因空气中蒸气多时，比重小，可以影响到同一大小物体的重量，这是测空气浮力的变化，这种制作实在不容易，也是在世界上最早、最有趣的事。
二十四节气水的性质不同也同样合乎科学道理。因为气压不同，气候温度不同，空气中的成分也有所不同，水的性质也应该不同。
乳穴水
是钟乳上之水，当然含有钙质。唐陈藏器说：“近乳穴处流出之水也。人多取水作饮，酿酒大有益。其水浓者重于他水，煎之上有盐花，此真乳液也。”同时亦认为：“与钟乳同功”。都是含碳酸钙的水。唐时已知其中含有特殊成分的“盐花”。含钙的水对人有益。
温汤
即温泉或沸泉。唐陈藏器说：“下有硫黄，即令水热，犹有硫黄臭。硫黄主诸疮，故水亦宜然”。温泉治病唐时已用过了。本草引胡仔渔隐丛话：“汤泉多作硫黄气，浴之则袭人肌骨。惟新安黄山是朱砂泉，春时水即微红色，可煮茗。长安骊山是磐石泉，不甚作气也。殊砂泉虽红而不热，当是雄黄耳。有砒石处亦有汤泉，浴之有毒。”对于温泉性质已有了解，且知温泉中所含的矿物成分，有硫黄、殊砂、磐石、砒石、雄黄等。当然此时还未想到水热矿床问题。但对温泉中含有些矿物的沉积，已经知道得很清楚。
碧海水
本草引东方朔十洲记云：“夜行海水，拨之有火星者，咸水也。色既碧故曰碧海”。海水的性质颜色，可能知道得还要早些。
盐胆水
即卤水。唐陈藏器说：“此乃盐初熟槽中沥下黑汁也”。本草说：“盐下沥水，则味苦不堪食，今人用此水收豆腐”。唐时作豆腐已用卤水。成分可能是氯化镁，性甚毒，“六畜饮一合，当时死，人亦然”。但用来作豆腐，就没有毒了。已经知道化合后，对于原来的化学性质有所改变。
阿井泉
“阿井在今兖州阳谷县，即古东阿县也。”管子曰：“济之水，其泉青白 其人坚勤，寡有疥瘙，终无痟醒”。水对于人的影响，战国时已经知道了[20]。凡含有碳酸钙的水，都有所谓“青白”色。沈括梦溪笔谈说：“古说济水伏流地中，今历下凡发地下皆是流水，东阿亦济水所经。……其性趣下，清而且重，用搅浊水则清。”对于这种泉水的性质，了解得很清楚。虽然当时没有科学的解释，但是对现象的观察，要算很仔细了。特别是“用搅浊水则清”，这是阿井泉所以清的原因，也就是海水所以清的原因。用阿井水和浊水相混，浊水就变清了，这种现象也只是近年来才有了解释。但这种事实，却认识得很早。
山岩泉水
尔雅说：“水正出曰滥泉;悬出曰沃泉;穴出曰沈泉。”[17]已经根据泉水的症状不同，分为三类了。又引陆羽话说：“凡瀑涌漱湍之水，饮之令人有颈疾”。可知山中有颈疾(大脖子病)是由于“水”也是早已知道了。现在西医是用吃碘化钾来防止。本草上引用药品甚多，如杜衡、贝母、黄药子、特别是海藻、海带、海苔等，远比西方用得早。直到现在还是治疗此病的方法。